De gemeente is ontstaan uit een plaatselijke Bijbelstudiegroep en is in 1998 gesticht, en de eerste jaren ook geleid, door zendeling Jake Huussen. In 2003 is een doorstart gemaakt, waarbij de gemeente voortaan werd bestuurd door oudsten en diakenen.
Begin 1998 startte de Vrije Baptisten Gemeente in Groot-Ammers met zondagse samenkomsten in het gebouw De Platanen (het voormalige dorpshuis). De initiatiefnemers hielden daarvoor al enige tijd bijbelstudie samenkomsten o.l.v. de in Nederland geboren Jake Huussen, die een Bijbelschool volgde in de V.S. Deze laatste wilde met zijn gezin terug naar Nederland om gemeenten te stichten in o.a. Amsterdam, maar kwam op uitnodiging van de familie Bijdevier ook regelmatig in Groot-Ammers, en startte er een Baptisten Gemeente.
De gemeente kreeg vanaf het begin de structuur van de Independent Baptist Church uit Amerika met Huussen aan de leiding. In de eerste maanden bezochten regelmatig veel mensen de diensten. Huussen startte ook een gemeente in Amsterdam, met overwegend Antillianen, en vanuit die gemeente bezochten een aantal leden de diensten in Groot-Ammers, zodat in die tijd de Ammerse gemeente ook in dat opzicht kleur vertoonde.
Nadat Huussen als voorganger een aantal jaar aan de gemeente verbonden was geweest, werd in 2003 besloten dat de gemeente zelfstandig verder zou gaan. Vanaf oktober 2003 ging zij zonder voorganger verder. Vanaf dat moment kreeg de gemeente meer de structuur van een Hollandse Baptisten Gemeente’. De gemeente kreeg in deze tijd veel steun VBG Papendrecht, die al eerder een dochtergemeente in Nieuw-Lekkerland hadden opgericht.
Vanaf dat moment werden oudsten aangesteld en werd de gemeente opgebouwd naar de gemeente zoals we deze nu kennen. De groei van het aantal leden bleef de eerste jaren beperkt. De groei kwam o.a. op gang door het ‘40 Dagen Doelgericht Leven’ project, waarbij veel buitenstaanders kwamen en later ook bleven.
Sinds 2010 houden we de zondagse samenkomsten op een nieuwe locatie: Sporthal de Reiger in Groot-Ammers. Vanaf dit moment geven we de gemeente de naam ‘De Levensboom’. Een nieuwe fase breekt aan in de gemeente, nieuwe mensen weten onze gemeente te vinden en we kunnen het gemeentewerk steeds meer op- en uitbouwen.